El Comité de Ética en Intervención Social (CEIS) de San Juan de Dios se creo en 2009 para tratar de abordar exigencias éticas, crear pautas, analizar Situación y ofrecía reflexiones a nuestra sociedad. Lo forman personas dedicadas a este Objetivo y que trabajan en el ámbito de la exclusión social, de la protección jurídica y la tutela, la discapacidad, la integración laboral, la inmigración o con personas sin hogar. El CEIS es una Comisión consultiva y independiente, de carácter interdisciplinar, cuya finalidad se asesorar a profesionales, colaboradores y familiares de San Juan de Dios e instituciones afines, en el ámbito de la intervenciones sociales y la atención a personas en situación de dependencia.